Маттиас Зендер окончил стоматологический факультет Бернского университета (Швейцария) в 1994 г., там же получил докторскую степень (Dr. med. dent.) в 1996 г. Совмещал практику в частной клинике с научной работой на кафедре клеточной биологии полости рта. В 1998–1999 гг. был сотрудником кафедры пародонтологии и биологии полости рта стоматологического факультета им. Г. Гольдмана в Бостонском университете (США). В 2001 г. получил сертификат специалиста в области эндодонтии Колумбийского университета (США). В 2005 г. защитил диссертацию на соискание степени PhD в университете Турку (Финляндия), а в 2007 г. стал доцентом Цюрихского университета.

Сейчас доктор Зендер возглавляет эндодонтическое отделение стоматологической клиники при Цюрихском университете. Специализируется на разработке стоматологических биоматериалов, диагностике патологий пульпы с помощью ДНК-маркеров и совершенствовании методик дезинфекции твердых тканей зуба.